Много лет назад святой Сэйя остановил Бога войны Марса и спас мир от разрушения. Богиня Афина воспитывает мальчика, жизнь которого спас Сэйя. Ведь именно ему суждено предотвратить новое пришествие Марса.

Коко растет в джунглях под опекой отшельника Заруда. Он знакомится с Сатоси и Пикачу и узнает о мире людей, а также об опасности, которая грозит его дому.