Прошло несколько недель после событий финала мультсериала «Бен 10: Инопланетная сила», в котором Вилгакс сдался. Бену Теннисону исполнилось 16 лет. Омнитрикс был разрушен и теперь ему нужно осваивать секреты Ультиматрикса - новая версия Омнитрикса, которая даёт доступ ко всем прошлым формам и

Обожаемая детьми во всем мире героическая четверка, полная неукротимой энергии, отправляется в мультприключения, расправляясь с негодяями, выслеживая злодеев и поглощая пиццу в безостановочном темпе.

Команда Квеста противостоит современному алхимику доктору Зину, который клонировал себя и создал армию рептилий-мутантов в тропических лесах Перу. Схватка оборачивается трагедией, навсегда меняющей жизнь Джонни, и ведет к кругосветной погоне за Зином, полной изучений артефактов и исследований